文章摘要:[目的]旨在探讨可变剪切（Alternative Splicing,AS）事件与肝细胞癌（Hepatocellular Carcinoma,HCC）预后的相关性，构建肝细胞癌患者预后模型，寻找HCC患者预后的生物标志物。[方法]主要分析了来自癌症基因图谱（TCGA）数据库的肝细胞癌RNA-seq数据与临床样本数据以及来自于TCGA-Splice Seq数据库的HCC可变剪切数据。采用单因素cox回归分析HCC中与预后相关的可变剪切事件。计算HCC患者AS事件风险值，构建HCC患者预后模型，并分析HCC患者的独立预后因素。结合RNA-seq数据提取HCC患者样本中剪切因子（Splicing Factor,SF）的表达量，构建AS与SF之间的调控网络。筛选高风险可变剪切基因中的关键调控SF，分析关键SF与HCC预后的关系。[结果]在HCC患者中，ISOC2、ARID1A、CRELD1的外显子跳跃等都是与HCC患者预后高度相关的AS事件。AS事件风险值低的患者预后显著优于AS事件风险值高的患者，且AS与SF之间的调控网络表明SF在调控网络中的调控具有多样性。[结论]HCC中AS事件的风险值可以作为独立预后指标。HCC预后有关的关键AS基因ISOC2、ARID1A、CRELD1与剪切因子SNRPB、SNRPF、CPSF6均可能成为HCC治疗的潜在靶点。

文章关键词:

论文DOI:10.16519/j.cnki.1004-311x.2021.05.0068

论文分类号:R735.7;Q811.4

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