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生物学论文_基于生物信息学分析TCEB1在肝癌中 

来源:肿瘤 【在线投稿】 栏目:期刊导读 时间:2021-11-02

文章摘要:为探讨转录延伸因子B1(Transcription Elongation Factor B Subunit 1,TCEB1)基因在肝癌中的表达和临床意义,利用GEPIA、Ualcan分析TCEB1在肝癌中的表达以及与患者临床病理特征和预后的关系;采用cBioPortal分析肝癌中TCEB1的基因改变情况;利用Linkedomics分析肝癌中TCEB1相关基因,进一步通过metascape对TCEB1相关基因进行GO和KEGG通路分析;最后通过Genemania构建TCEB1相互作用蛋白网络。结果显示,TCEB1在肝癌组织中显著高表达(P<0.05),且表达水平越高,患者肿瘤分级和预后越差(P<0.05)。cBioPortal数据库检测结果显示7%(52/800)的肝癌样本发生TCEB1基因拷贝数扩增,且与其mRNA表达呈正相关,患者预后显著较差(P=0.0129)。GO分析结果提示TCEB1及其相关基因的分子功能主要与转录因子结合、泛素样蛋白转移酶活性、钙粘蛋白的结合等有关。Genemania分析提示TCEB1与TCEB2、VHL、CUL2等蛋白相互作用。本研究表明TCEB1可能作为肝癌患者预后的生物标记物和治疗肝癌新的潜在靶点。

文章关键词:

论文DOI:10.16605/j.cnki.1007-7847.2021.05.0157

论文分类号:R735.7;Q811.4

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