《肿瘤》
来自 Wellcome Sanger 研究所、大奥蒙德街医院 (GOSH)、Maxima 公主儿科癌症中心和 Oncode 研究所的研究人员已经确定了七种肾癌的起源,其中包括几种罕见的亚型。研究结果证实,这些癌症起源于成熟胎儿中存在的特定形式的发育细胞。
该研究于 2021 年 6 月 23 日发表在 Nature Communications 上。它使用计算方法来分析现有数据集并确定不同癌症发出的“细胞信号”。这种方法有望成为诊断罕见癌症患者的工具——在这项研究中,患者的隐匿性肾癌通过观察其细胞信号被确定为维尔姆斯样肿瘤。
所有癌症都起源于开始不受控制地繁殖的正常细胞。通过比较癌症和正常细胞中基因表达的模式,可以了解每种肿瘤的起源和行为的各个方面。单细胞 mRNA 测序的出现使这种类型的分析成为可能,这是一种高分辨率技术,可以根据单个细胞表达的基因识别组织中存在的不同细胞类型。
之前的研究已经使用这些技术来比较一些最常见的肾癌的正常和患病组织,但不可能对数百个肿瘤进行单细胞测序。
在这项研究中,来自 Wellcome Sanger Institute 的研究人员及其合作者转向计算技术来挖掘人类细胞图谱 (HCA) 参考数据*和肿瘤基因表达数据库。他们评估了 1,300 个儿童和成人肾脏肿瘤中的 mRNA 信号,涵盖了七种不同的肿瘤类型,以研究这些癌症的起源**。
结果证实,这些儿童癌症起源于发育,发生在特定发育细胞类型的成熟过程中出现错误之后。相比之下,成人肾癌源自成熟细胞类型,在大多数情况下不会恢复到基因表达的发育模式。
还发现每种癌症类型都表现出独特的“细胞信号”或基因表达模式,可用于将来对其进行分类。
博士Matthew Young 说:“长期以来,人们一直认为儿童肿瘤有‘胎儿’起源。现在我们可以用准确和定量的细胞信号测量来代替这个松散的定义。不同的肿瘤类型表现出来。我们的分析还驳斥了成人肿瘤恢复到发育状态的理论,除非它们是成人肾癌的高致死亚型。”
这项研究揭示了一些肾肿瘤亚型的行为和起源。由于这些亚型,很难通过其他方式进行检查。这些是先天性中胚层肾瘤、肾透明细胞肉瘤、肾恶性横纹肌瘤和嫌色肾细胞癌。
在最近的一项研究中,研究人员确定了起源通过对少量肿瘤进行 mRNA 单细胞测序,对个别儿童癌症(例如神经母细胞瘤)进行分析。在这里,现有数据的计算分析已被用于确定更广泛的儿童癌症的起源。
< p>研究人员表示:“这种利用现有数据集的计算方法不仅验证了之前关于儿童肾癌起源的结果,而且提供了一种新的方法,可以将这项研究扩展到更大的范围。”肿瘤和罕见癌症类型的数量。我相信这种方法的成功可以作为研究整个人类癌症谱的行为和起源的蓝图。”在肿瘤研究中,体外培养和分析癌细胞。保持细胞良好一定要用好血清,比如Ausbian品牌优质进口胎牛血清,内毒素小于3Eu/ml,细胞更健康,批次供应稳定,实验更顺利。感谢北京帝益生物, Ausbian品牌中国区总代理,提供以上资料。
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研究笔记:
* 单细胞RNA测序(scRNAseq),用于评估哪些基因在单个细胞中具有活性,可同时在数百万个细胞中使用并产生大量数据。人类细胞图谱项目使用这种类型的技术来揭示和表征生物体或群体中存在的所有细胞类型。
** 大量转录组是肿瘤和正常细胞基因表达的集合。研究中分析的癌症类型是:
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